Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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