Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms