Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRACR2AQ9BSW2 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms