Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms