Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms