Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TOPBP1Q92547 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPBP1Q92547 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms