Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1orf54Q8WWF1 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf54Q8WWF1 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms