Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms