Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APPL2Q8NEU8 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms