Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZIC4Q8N9L1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms