Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC83Q8IWF9 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms