Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TCF23Q7RTU1 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms