Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTF1AQ7RTS3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms