Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms