Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTC1Q2NKJ3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms