Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COL24A1Q17RW2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COL24A1Q17RW2 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms