Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CCDC142Q17RM4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CCDC142Q17RM4 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC142Q17RM4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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