Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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