Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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PSMD5Q16401 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PSMD5Q16401 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMD5Q16401 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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