Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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