Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SCGB2A2Q13296 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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SCGB2A2Q13296 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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SCGB2A2Q13296 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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SCGB2A2Q13296 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SCGB2A2Q13296 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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