Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM2Q13029 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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