Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NPRL3Q12980 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms