Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC010551.3-201ENST00000563772 463 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PTPN13Q12923 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PTPN13Q12923 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PTPN13Q12923 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TROAP-210ENST00000549534 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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