Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TROQ12816 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TROQ12816 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TROQ12816 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TROQ12816 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TROQ12816 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TROQ12816 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TROQ12816 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TROQ12816 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TROQ12816 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TROQ12816 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TROQ12816 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TROQ12816 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TROQ12816 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TROQ12816 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TROQ12816 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TROQ12816 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TROQ12816 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TROQ12816 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TROQ12816 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TROQ12816 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TROQ12816 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TROQ12816 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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