Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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KCNH2Q12809 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNH2Q12809 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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