Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNA1Q09470 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms