Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RPL23P62829 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPL23P62829 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms