Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CASP9P55211 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CASP9P55211 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CASP9P55211 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms