Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC5A3P53794 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms