Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UBE2D1P51668 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms