Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA2P51531 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms