Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms