Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms