Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC9A1P19634 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms