Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYN1P17600 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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