Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BRAFP15056 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BRAFP15056 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BRAFP15056 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BRAFP15056 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BRAFP15056 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BRAFP15056 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BRAFP15056 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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