Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HLA-DQB1P01920 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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