Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN2BO60939 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SCN2BO60939 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCN2BO60939 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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