Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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