Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
O00370 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
O00370 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
O00370 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
O00370 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
O00370 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
O00370 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
O00370 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
O00370 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms