Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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