Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 519.8 ms