Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRF3Q9ULT6 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms