Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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