Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms