Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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UBE2OQ9C0C9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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UBE2OQ9C0C9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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UBE2OQ9C0C9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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UBE2OQ9C0C9 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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UBE2OQ9C0C9 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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UBE2OQ9C0C9 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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UBE2OQ9C0C9 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2OQ9C0C9 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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