Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ALDOAP2-201ENST00000398050 1076 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00271-202ENST00000436554 655 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007557.2-201ENST00000440900 583 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SNHG11-211ENST00000444816 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PLA2G6-213ENST00000447598 567 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SNHG11-214ENST00000457218 880 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL559P-201ENST00000476501 297 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC022447.2-201ENST00000509750 543 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MRNIP-216ENST00000521333 410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AL391152.1-202ENST00000551408 624 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 B9D1-213ENST00000575403 928 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC023983.1-201ENST00000579347 567 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SMIM6-202ENST00000579469 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC069366.2-201ENST00000583643 430 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC020663.2-201ENST00000592465 720 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006547.1-206ENST00000600617 878 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC109826.1-203ENST00000624259 1105 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 WASH5P-206ENST00000632506 1147 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms