Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MYH11-202ENST00000396324 6847 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms