Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX27Q96L92 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms